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    SNAP-ChIP ® Spike-in Controls 如何工作?

    發布時間: 2021-06-25  點擊次數: 1220次

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    SNAP-ChIP ®

    認證抗體

    您可以信賴的 ChIP 抗體

    抗體選擇是研究人員在設計 ChIP 實驗時必須做出的最重要的決定,但嚴格的抗體驗證既昂貴又耗時。在 EpiCypher,我們認識到這一挑戰,并已著手進行大量工作來分析和鑒定性能最高的 ChIP 抗體。

     

     

    SNAP-ChIP ®認證抗體使用 EpiCypher 專有的SNAP-ChIP ®摻入 技術進行測試,提供針對特定核小體底物的強大應用內抗體驗證。這種嚴格的測試可確保在您的 ChIP 實驗中發揮可靠的性能。

     

    低交叉反應性知識產權效率高廣泛的批量測試定期添加新抗體

     

    SNAP-ChIP ® Spike-in Controls 如何工作?

    SNAP-ChIP 摻入是 DNA 條形碼重組核小體的集合,可直接添加到 ChIP 實驗中以評估抗體特異性和效率。

     

    IP 之前,spike-ins 被添加到標準的 ChIP 工作流程中。PTM 特異性 DNA 條形碼的回收率由 qPCR 或下一代測序確定,揭示脫靶相互作用和富集(與摻入的輸入染色質)。

    SNAP-ChIP:使用核小體鑒定 ChIP 抗體的平臺

    抗體特異性

    SNAP-ChIP ®認證抗體經過特異性(即交叉反應性;左 y 軸)和富集(即回收率、效率;右 y 軸)測試,SNAP-ChIP 認證抗體與相關抗體的交叉反應性低于 20% PTM(藍色條)并從輸入染色質(綠色條)中恢復至少 5% 的目標 PTM

     

    不符合這些標準的抗體(參見“失敗”圖)不適合 ChIP-seq,使用時應格外小心,因為它們可能會導致不正確的生物學解釋。

    為什么核小體環境很重要?

    使用 SNAP-ChIP 摻入對照,我們發現:

     

    常用的組蛋白 PTM 肽陣列不能預測 ChIP 中的抗體性能(Shah et al. Mol. Cel 2018)。

    許多被高度引用的抗體與相關標記發生交叉反應,導致錯誤的生物學解釋( Shah et al. 2018 and Lam et al. 2019)。

    生產批次之間的抗體特異性可能會有很大差異(請參閱我們的博客)。

    SNAP-ChIP ® Spike-In 控制面板

    ChIP 定義的對照。我們提供各種組蛋白 PTM 的面板,包括賴氨酸甲基化和酰化。

     

    SNAP-ChIP ®認證抗體

    這些抗體已經使用 SNAP-ChIP 摻入進行了驗證,并具有特異性和目標富集。

     

    SNAP-ChIP ®驗證服務

    讓專家幫忙!借助 SNAP-ChIP 驗證服務,EpiCypher 將幫助您找到適合您的 ChIP-seq 研究的抗體。

     

     

    用于 CUT&RUN CUT&Tag CUTANA™ 檢測

    高性能基因組作圖分析

    用于 CUT&RUN CUT&Tag CUTANA™ 檢測 利用免疫束縛技術的最新進展提供高效、超靈敏的染色質定位能力。與表觀基因組分析的標準檢測方法 ChIP-seq 相比,這兩項激動人心的新技術具有明顯的優勢,包括:

     

    需要更少的細胞每個樣本只需要 3-5 百萬個測序讀數改進的信噪比顯著節省時間和成本

     

    超低輸入染色質作圖分析

    CUTANA™ CUT&Tag 檢測基于免疫束縛技術的最新進展,提供創新的工作流程,使用 < 5,000 個細胞對組蛋白 PTM 進行分析。

     

    CUT&Tag 是一項新興技術,其協議正在積極開發中,包括單細胞工作流程。當使用 < 5,000 個細胞核或細胞分析組蛋白 PTM 時,這種方法是理想的。對于大多數實驗,EpiCypher 強烈建議使用我們強大的 CUTANA™ CUT&RUN 檢測,該檢測兼容 5,000 500,000 個細胞,并針對各種靶標、樣品輸入、固定條件進行了優化。

     

    * 不建議將 CUT&Tag 用于染色質相關蛋白 請改用 CUTANA CUT&RUN 檢測。

     

    CUT&Tag 是如何工作的?

    Ç leavage ünDer ?具體目標和標記心理狀態(CUT&標記)是一種新型的immunotethering測定中,基于切割下目標和推出使用核酸酶(CUTRUN)方法。

     

    CUT&Tag 中,蛋白 A、蛋白 G Tn5 轉座酶的融合用于催化抗體結合染色質上的同步切割和測序接頭連接。在 CUT&Tag 中使用 Tn5 是一個關鍵的進步,因為這一步驟消除了染色質碎裂和文庫制備的需要。

     

    ChIP-seq 分析相比,CUT&Tag 分析顯示出顯著改善的信噪比 (S/N),特別是用于在超低樣本輸入中映射組蛋白 PTM

     

     

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